Ya le he instalado la nueva ROM oficial (K900_ROW_1_S_2_009_0288_131227).
Al final no lo he hecho con flashtools. Lo he hecho desde el Recovery pero con la opción "update from ADB".
Es la forma más sencilla "para lo que yo entiendo" de hacerlo. Con las Android SDK tools.
Al terminar la instalación y configurarle la wifi, me ha salido una actualización (K900_ROW_1_S_2_009_0498_140723). La ha actualizado sin problemas.
Salu2