Respuesta directamente de H3ROS, adaptado:
GravityBox = Desinstalar como una aplicación normal.
Xposed = Abre la aplicación, selecciona framework y desinstalar. Reinicie y luego desinstalar la aplicación.
ViPER4Android = Abre la aplicación, pulsa la tecla de opciones, seleccione "uninstall driver" y reinicia. Después desinstala la aplicación mediante Titanium Backup.
** Si no puedes acceder a la opción "uninstall driver", selecciona "estado del driver", luego pulse de nuevo y vuelva a intentarlo.
De todas formas no ganarías memoria libre adicional desinstalando Xposed o Viper. Sería eliminar una gran cantidad de funciones útiles también, así que no recomendaría eliminar nada.