Mira tú, según la información que encontré en
XDA-Developers, el m9kefs1 contenía información de la radio y no del IMEI, sin embargo, como te dije, debías hacer una copia o backup de los tres archivos antes de proceder con alguna de las copias que obtuvieras, si es así podrías hacer una restauración y recuperar el IMEI original de tu equipo.
Una pregunta, no entendí bien, ¿usaste el Freegee para restaurar el EFS o copiaste el m9kefs1 manualmente?. Si usaste el Freegee pues has reemplazado los tres archivos y no sólo el m9kefs1.