Hola, el root no te impide actualizar, asi que lo puedes hacer con toda confianza, cuando salga la 4.3 no habra root para ella por algunas semanas o dias, pero siempre puedes regresar a una sin root, si nadamas quieres el root para eliminar basura de operadora, podrias instalar la 4.3 libre, o incluso si no quieres rotear podrias instalar la que publique que es totalmente libre de operadora.
Saludos