hola dsalces80,
tengo entendido que con el salto a 4.3 el sistema monta la sd en un lugar diferente a donde lo hacia.
si eres root, busca por mount/shell/emulated/0
o por mount/shell/emulated
yo ahora tengo otro terminal y lo ha hecho asi, supongo que con el nexus s tambien lo hara igual.
a ver si te aparecen.
creo que si no has formateado la sd, no has perdido nada de lo que tenias, pero ahora lo colocara en otro lugar.
comprueba todo, salva los datos y por ultimo cuando estes seguro, formatea la sd desde recovery, vuelve a instalar las aplicaciones que necesites y copia de nuevo las fotos y demas.
deberia funcionar.
otra solucion es instalar el root explorer y buscar los archovos por el nombre a ver donde los ha colocado.
suerte,